周作人曾经提及：翻阅《诗经新注》“颇有用处”，并称“山本溪愚世为儒医，精通本草学，善绘画，所图画动植凡千四百幅三千余种，皆极精美，又能诗文，著有《对竹斋诗集》及《七经解》，俞曲园先生见之，曾贻书称其能诠明古学，真有志之士也云”。1902年，清儒吴汝纶奉命赴日本考察学制，与山本章夫一见如故，称其为“儒宗”，回国后曾寄书给他。

山本章夫著书颇丰，与经学相关者，有《论语补注》《孟子补注》《考订大学》《考订中庸》《诗经新注》《易经新注》《春秋经文直解》《考订孝经》等，其中《论语补注》成为清朝时期湖南省湖南学堂之教科书。

他身处新旧变动的明治时期，其经学研究成果，不仅体现了日本学者对中国古代经典的热爱，也反映了当时日本汉学的发展水平。今将其经学著作汇编为《山本章夫校注中国古籍集》，并于篇末附《溪愚山本章夫先生小传》，以飨读者。